1- सोमनाथ (गुजरात), 2- मल्लिकार्जुन (आंध्रप्रदेश), 3- महाकाल (मध्यप्रदेश), 4- ममलेश्वर (मध्यप्रदेश), 5- बैद्यनाथ (झारखंड), 6- भीमाशंकर (महाराष्ट्र), 7- केदारनाथ (उत्तराखंड), 8- विश्वनाथ (उत्तरप्रदेश), 9- त्र्यम्बकेश्वर (महाराष्ट्र), 10- नागेश्वर (गुजरात),11-  रामेश्वरम् (तमिलनाडु), 12- घृश्णेश्वर (महाराष्ट्र), 13- अमरनाथ (जम्मू-कश्मीर), 14- पशुपतिनाथ (नेपाल), 15- कालेश्वर (तेलंगाना), 16- श्रीकालाहस्ती (आंध्रप्रदेश), 17- एकम्बरेश्वर (तमिलनाडु), 19- अरुणाचल (तमिलनाडु), 20- तिलई नटराज मंदिर (तमिलनाडु), 21- लिंगराज (ओडिशा), 22- मुरुदेश्वर शिव मंदिर (कर्नाटक), 23- शोर मंदिर, महाबलीपुरम् (तमिलनाडु), 24- कैलाश मंदिर एलोरा (महाराष्ट्र), 25- कुम्भेश्वर मंदिर (तमिलनाडु), 26- बादामी मंदिर (कर्नाटक) आदि कई प्राचीन और चमत्कारिक मंदिर प्रसिद्ध हैं।

प्रमुख रूप से शिवलिंग 2 प्रकार के होते हैं। पहला आकाशीय या उल्का शिवलिंग और दूसरा पारद शिवलिंग। पहला उल्कापिंड की तरह काला अंडाकार लिए हुए। ऐसे शिवलिंग को ही भारत में ज्योतिर्लिंग कहते हैं। दूसरा मानव द्वारा निर्मित पारे से बना शिवलिंग होता है। पारद विज्ञान प्राचीन वैदिक विज्ञान है। इसके अतिरिक्त पुराणों के अनुसार शिवलिंग के प्रमुख 6 प्रकार होते हैं- देवलिंग, असुरलिंग, अर्शलिंग, पुराणलिंग, मनुष्यलिंग और स्वयंभू लिंग।

शिवलिंग के 3 हिस्से होते हैं। पहला हिस्सा जो नीचे चारों ओर भूमिगत रहता है। मध्य भाग में आठों और एक समान पीतल बैठक बनी होती है। अंत में इसका शीर्ष भाग, जो कि अंडाकार होता है जिसकी कि पूजा की जाती है। इस शिवलिंग की ऊंचाई संपूर्ण मंडल या परिधि की एक तिहाई होती है। ये 3 भाग में है ब्रह्मा (नीचे), विष्णु (मध्य) और शिव (शीर्ष) के प्रतीक हैं। शीर्ष पर जल डाला जाता है, जो नीचे बैठक से बहते हुए बनाए गए एक मार्ग से निकल जाता है। प्राचीन ऋषि-मुनियों के जरिए ब्रह्मांड के वैज्ञानिक रहस्य को समझकर इस सत्य को प्रकट करने के लिए विविध रूपों में इसका स्पष्टीकरण दिया गया है।

शिवलिंग में एक पत्थर की आकृति होती है। जलाधारी पीतल की होती है और नाग या सर्प तांबे का होता है। शिवलिंग पर बेलपत्र और धतूरे या आंकड़े के फूल चढ़ते हैं। शिवलिंग पर जल गिरता रहता है। कहते हैं कि ऋषि-मुनियों ने प्रतीक रूप से या प्राचीन विद्या को बचाने के लिए शिवलिंग की रचना इस तरह की है कि कोई भी उसके रहस्य को समझकर उसका लाभ उठा सकता है, जैसे शिवलिंग अर्थात पारा, जलाधारी अर्थात पीतल की धातु, नाग अर्थात तांबे की धातु आदि को बेलपत्र, धतूरे और आंकड़े के साथ कुछ औषधि मिलाकर चांदी या सोना बनाया जा सकता है।

पुरातात्विक निष्कर्षों के अनुसार प्राचीन शहर मेसोपोटामिया और बेबीलोन में भी शिवलिंग की पूजा किए जाने के साक्ष मिले हैं। इसके अतिरिक्त मोहन-जो-दाड़ो और हड़प्पा की विकसित संस्कृति में भी शिवलिंग की पूजा किए जाने के पुरातात्विक अवशेष प्राप्त हुए हैं। सभ्यता के आरंभ में लोगों का जीवन पशुओं और प्रकृति पर निर्भर था, इसलिए वो पशुओं के संरक्षक देवता के रूप में भी पशुपति की पूजा करते थे। सैंधव सभ्यता से प्राप्त एक सील पर 3 मुंह वाले एक पुरुष को दिखाया गया है, जिसके आस-पास कई पशु हैं। इसे भगवान शिव का पशुपति रूप माना जाता है। 

ऐतिहासिक प्रमाणों के अनुसार विक्रम संवत् के कुछ सहस्राब्दीग पूर्व संपूर्ण धरती पर उल्कापात का अधिक प्रकोप हुआ। आदिमानव को यह रुद्र (शिव) का आविर्भाव दिखा। पृथ्वी जहां-जहां ये पिंड गिरे, वहां-वहां इन पवित्र पिंडों की सुरक्षा के लिए मंदिर बना दिए गए। इस तरह धरती पर हजारों शिव मंदिरों का निर्माण हो गया। उनमें से प्रमुख थे 108 ज्योतिर्लिंग, लेकिन अब केवल 12 ही बचे हैं। शिव पुराण के अनुसार उस समय आकाश से ज्योति पिंड पृथ्वीर पर गिरे और उनसे थोड़ी देर के लिए प्रकाश फैल गया। इस तरह के अनेक उल्का पिंड आकाश से पृथ्वी पर गिरे थे।

भगवान शिव ने ब्रह्मा और विष्णु के बीच श्रेष्ठता को लेकर हुए विवाद को सुलझाने के लिए एक दिव्य लिंग (ज्योति) को प्रकट किया था। इस ज्योतिर्लिंग का आदि और अंत ढूंढते हुए ब्रह्मा और विष्णु को शिव के परब्रह्म स्वरूप का ज्ञान हुआ। इसी समय से शिव को परब्रह्म मानते हुए उनके प्रतीक रूप में ज्योतिर्लिंग की पूजा आरंभ हुई। हिन्दू धर्म में मूर्ति की पूजा नहीं होती, लेकिन शिवलिंग और शालिग्राम को भगवान शंकर और विष्णु का विग्रह रूप मानकर इसी की पूजा की जानी चाहिए।

पुराणों में शिवलिंग को कई अन्य नामों से भी संबोधित किया गया है। जैसे प्रकाश स्तंभलिंग, अग्नि स्तंभलिंग, ऊर्जा स्तंभलिंग, ब्रह्माण्डीय स्तंभलिंग आदि। ज्योतिर्लिंग उत्पत्ति के संबंध में पुराणों में अनेक मान्यताएं प्रचलित हैं।  वेदानुसार ज्योतिर्लिंग यानी 'व्यापक ब्रह्मात्मलिंग' जिसका अर्थ है 'व्यापक प्रकाश', जो शिवलिंग के 12 खंड हैं। शिव पुराण के अनुसार 1- ब्रह्म 2- माया 3- जीव 4-मन 5- बुद्धि 6- चित्त 7- अहंकार 8- आकाश 9- वायु 10-अग्नि 11- जल और 12- पृथ्वी को ज्योतिर्लिंग या ज्योति पिंड कहा गया है।